Профессиональный футбольный клуб «Ника» был образован в 2001 году на базе имеющей шестилетнюю историю Региональной общественной организации «Клуб поддержки детского футбола «Ника». ФК «Ника» создавался с целью подготовки высококвалифицированных футболистов из числа наиболее одаренных юных спортсменов Москвы, Московской области и других регионов Российской федерации. Сегодня в клубе, помимо профессиональной команды второго дивизиона и команды, выступающей среди ЛФК, совершенствуют свое мастерство более 200 ребят – воспитанников Детско-юношеской школы футбола (ДЮШФ) «Ника». В настоящее время на территории учебно-тренировочной базы «Труд» на Варшавском шоссе построен новый стадион с искусственным полем и трибунами на 3 тысячи мест и скоро будет сдан в эксплуатацию многофункциональный спортивный комплекс. В планах клуба – также строительство гостиницы для футболистов. Более двух десятков выпускников групп подготовки клуба – в составах клубов Премьер-лиги, а также команд первого и второго дивизионов. Команда «Ника», выступающая во втором дивизионе, укомплектована в основном игроками 1987-89 годов рождения. Абсолютное большинство футболистов – воспитанники групп подготовки и ДЮШФ «Ника». Пополнение команды в основном за счет подготовленных в своем коллективе футболистов – принципиальная позиция руководства клуба. Российские любители футбола узнали о существовании этой команды в 2001 году, когда коллектив принял участие в соревнованиях 2 дивизиона. Дебют на всероссийской арене получился неудачным – команда заняла последнее место и затем на протяжении трех сезонов выступала в соревнованиях ЛФК в столице. Но с 2005 года «Ника» вновь играет на профессиональном уровне.
РЕЗУЛЬТАТЫ «НИКИ» В ПЕРВЕНСТВАХ РОССИИ
| Сезон | Дивизион | Место | И | В | Н | П | М | 0 |
| 1999 | Третий дивизион, "Центр-Москва" (КФК) | 13 из | 34 | 8 | 6 | 20 | 28-64 | 30 |
| 2000 | Третий дивизион, "Центр-Москва" (КФК) | 2 из 16 | 30 | 24 | 3 | 3 | 126-22 | 75 |
| 2001 | Второй дивизион, "Запад" | 20 из 20 | 38 | 6 | 2 | 30 | 36-90 | 20 |
| 2002 | Третий дивизион, "Центр-Москва" (КФК) | 9 из 21 | 40 | 17 | 9 | 14 | 73-59 | 60 |
| 2003 | Третий дивизион, "Центр-Москва" (КФК) | 3 из 19 | 36 | 24 | 5 | 7 | 93-36 | 77 |
| 2004 | Третий дивизион, "Центр-Москва" (КФК) | 4 из 15 | 28 | 17 | 7 | 4 | 80-29 | 58 |
| 2005 | Второй дивизион, "Центр" | 11 из 18 | 34 | 12 | 9 | 13 | 44-46 | 45 |
| 2006 | Второй дивизион, "Центр" | 16 из 18 | 34 | 8 | 9 | 17 | 37-53 | 33 |
| 2007 | Второй дивизион, "Центр" | 13 из 16 | 30 | 9 | 1 | 20 | 28-53 | 28 |
| 2008 | Второй дивизион, "Центр" | 17 из | 34 | 7 | 2 | 25 | 23-77 | 23 |
| 2009 | Второй дивизион, "Центр" | 16 из 17 | 32 | 4 | 5 | 23 | 20-86 | 17 |
| 2010 | Второй дивизион, "Центр" | 16 из 16 | 30 | 0 | 3 | 27 | 11-89 | 3 |
Крупные победы: 2000: "Ника"-"Десна-Г.О.Л." (Внуково) 13:1
2000: "Ника"-"Старт-Перово" 12:0
2003: "Ника"-"Поддержка" (Одинцово) 10:0
2000: "Ника"-"Спартак-мол" 10:1
2003: "Ника"-"СиМ" 9:0
2004: "Ника"-"Строгино" 9:0
2000: "Ника"-СДЮШОР "МИФИ" 9:1
Крупные поражения: 2010: "Торпедо" М-"Ника" 7:0
VS
